Blast 实现了五种可能的序列比对方式:
blastp:蛋白序列与蛋白库做比对,直接比对蛋白序列的同源性。
blastx:核酸序列对蛋白库的比对,先将核酸序列翻译成蛋白序列(根6种可能的蛋白序列),然后再与蛋白库做比对。
blastn:核酸序列对核酸库的比对,直接比较核酸序列的同源性。
tblastn:蛋白序列对核酸库的比对,将库中的核酸翻译成蛋白序列,然后进行比对。
tblastx:核酸序列对核酸库在蛋白级别对蛋白序列进行比对,将库和待查序列都翻译成蛋白序列,然后对蛋白序列进行比对
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